大家都知道，泌尿系感染根据是否有排尿机制功能和解剖结构异常（如尿路梗阻、尿流不畅、结石、尿路畸形、膀胱输尿管反流等）分为复杂性尿路感染和非复杂性尿路感染。对于急性单纯性上、下尿路感染病原菌80%以上为（G-）大肠埃希菌；而复杂性尿路感染的病原菌除仍以大肠埃希菌多见（30%～50%），也可为肠球菌属（G+）、变形杆菌属、克雷伯菌属等；医院获得性尿路感染的病原菌尚有葡萄球菌属（G+）、念珠菌属等。
莫西沙星的抗菌谱中保留原有喹喏酮类药物对G-的抗菌作用，而且其结构的改进增加了对G+的抗菌活性。从尿路感染的病原菌而言，莫西沙星的抗菌谱基本上已经覆盖了相关的病原菌。
但是，对于泌尿系感染，应选择在尿中能达到有效药物浓度的抗菌药物，否则即使体外药敏试验显示为敏感，但尿中药物浓度不足，也不能有效清除尿中病原菌。有研究显示，莫西沙星只有给药量的45%以原型排泄，而经肾脏排泄的约20%，也就是说，莫西沙星在尿中能够发挥作用的只有给药量的20%。在尿液中的浓度不足以杀灭常见致病菌。并且，目前莫西沙星被批准的适应证为：①急性细菌性鼻窦炎。②慢性支气管炎急性发作。③社区获得性肺炎。④非复杂性皮肤和皮肤组织感染；⑤复杂性皮肤和皮肤组织感染；⑥复杂性腹腔内感染；⑦鼠疫。因此，泌尿系感染选用莫西沙星并不能达到良好的治疗效果，应避免选用。
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